アーケード版と同様に難易度やステージ構成の異なるルートを選択して、
ステージをクリアしていくのがアーケードモードだ。
全９ステージをクリアするとエンディングとなるが、ある条件を満たすことで
ＥＸステージという特殊なステージに挑むことができるぞ。

アーケード版で使用可能となった機体は最初から全て選択可能だ。
アーケード版で最後の隠し要素だったアカツキ（シラヌイ装備）ももちろん使用できる。

ＭＳを決定した後はパイロットを選択。
最初に決定したルートと、選択したパイロットの所属陣営で出現する敵などが変化するぞ。

アーケードモードでは２人のプレイヤーで「協力」「対戦」プレイが可能だ。
２人目の乱入時に「協力」と「対戦」のどちらを行うか選択できる。

ある条件を満たすことで、もともと選べる6ルート以外にも、新しいルートが遊べるようになるのだ！
もちろん、新ルートにはPS2版専用ＭＳや新ステージが多数登場。アーケードファンにも嬉しい要素だ！